Es wird allgemein angenommen, dass sich die Grabstätte des heiligen Matthäus, eines der Autoren der Heiligen Schrift, am Grund des Issyk-Kul-Sees befindet. Nach dem Tod des Apostels in Syrien im 3. Jahrhundert verlegte eine Gruppe von Christen aus Angst vor einer Schändung durch die Römer die Grabstätte des Heiligen Matthäus nach Zentralasien. Sie suchten nach einem Ort, den kein römischer Legionär erreichen konnte. Die Christen fanden einen großen See mit klarem Wasser. Das war der Issyk-Kul-See. Dort überließen sie der Erde die Reliquien des Apostels und gründeten daneben ein Kloster. Später, als der Seespiegel anstieg, gerieten das Kloster und die Grabstätte des Apostels unter Wasser. Ein zentraler Bestandteil dieser Theorie ist die berühmte katalanische Karte, die ein armenisches Kloster in der Nähe des sogenannten Issikol-Sees in Zentralasien mit der Inschrift bezeichnet, dass es sich um die Ruhestätte des heiligen Matthäus handelt.