Существует гипотеза, что на дне озера Иссык-Куль покоятся мощи апостола Матфея, одного из авторов Священного писания. После гибели апостола в Сирии, в III в. верующие христиане, опасаясь поругания святыни римлянами, перенесли мощи в Среднюю Азию. Они должны были захоронить его на земле, куда не ступала нога римского легионера. Древние христиане нашли озеро с чистой водой. Это и было озеро Иссык-Куль. Там они основали монастырь, заложив прах апостола в раку, но со временем она ушла под воду. Опорой гипотезы является также знаменитая «Каталонская карта», где обозначен монастырь вблизи некого озера Иссиколь в Средней Азии и сделана надпись о том, что именно там находятся мощи Апостола Матфея.